Projekte in den Förderprogrammen des BMEL, betreut durch den Projektträger BLE (PT BLE)
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| Titel: | Metadatenbank für ernährungsepidemiologische Studien (ENPADASI) - Teilvorhaben 7 |
|---|---|
| Titel (englisch): | The European Nutrition Phenotype Assessment and Data Sharing Initiative |
| Akronym: | ENPADASI |
| Beschreibung (dt.): | Ziel des Projekts ENPADASI ist es, eine open-access-basieren Forschungsinfrastruktur zu schaffen, die einerseits Daten einer Vielzahl unterschiedlichster Ernährungsstudien aufnehmen kann und andererseits eine kombinierte, studienübergreifende Datenauswertung ermöglicht. Auf diese Weise wird • die statistische Power der Datenanalysen verbessert; • der Bedarf an neuen (Interventions-)Studien reduziert; • die Verifizierung von Studienergebnissen anhand anderer Studienpopulationen erleichtert; • das Verständnis verbessert, wie Genotyp und Phänotyp verbunden sind und welche Auswirkungen sich daraus für die menschliche Gesundheit ergeben. Im Rahmen von ENPADASI werden folgende Arbeitsschritte unternommen: • Definition von Standards, um bestehende Datenbanken zu verknüpfen und die Einbindung von Daten aus zukünftigen Ernährungsstudien zu ermöglichen; • Aufbereitung und Bereinigung von Daten für die Einbindung in die ENPADASI Datenbank; • Beurteilung und Validierung der Qualität der eingebundenen Studien; • Entwicklung der technischen Infrastruktur mit verteilten Hubs; • Entwicklung von Ontologien und Tools zur studienübergreifende Datenauswertung; • Ausarbeitung von Identifizierungsparametern als Grundlage biologischer Interpretationen; • Entwicklung von eindeutigen Data-Sharing-Richtlinien, um die Abneigung vieler Wissenschaftler gegen eine Datenbereitstellung für die Scientific Community zu überwinden. Diese Richtlinien werde Aspekte wie Ethik, Datenschutz und Schutz geistigen Eigentums umfassen; • Entwicklung von Schulungsunterlagen zur künftigen Nutzung der ENPADASI Infrastruktur; • Entwicklung von Nachhaltigkeitsstrategien zum Fortbestand von ENPADASI über den Förderzeitraum hinaus. |
| Beschreibung (engl.): | The main objective of the ENPADASI project is to deliver an open access research infrastructure that will a) host data from a wide variety of nutritional studies and b) facilitate combined and overarching data analyses, and thereby • increase the statistical power of data analyses; • reduce the need for new (intervention) studies; • facilitate verification of study results in different cohorts; • increase our understanding of how food and nutrition can improve human health. To attain these aims, ENPEDASI will: • Define standards in order to connect existing databases and to facilitate the integration of data from future nutritional studies. • Curate data for integration into the ENPADASI database. • Assess and validate the quality of the incorporated studies. • Develop the technical infrastructure with distributed hubs. • Develop ontologies and tools for integrated analyses of multiple studies. • Map identifiers to facilitate biological interpretation. • Develop data sharing guidelines to overcome the reluctance of many researchers to make their data available to the scientific community. These guidelines will cover aspects such as ethical issues, data protection, and protection of intellectual property. • Develop training materials for future usage of the ENPADASI infrastructure. • Develop strategies to ensure the sustainability of ENPADASI beyond the funding period of the project. The work within ENPADASI is organized in 6 Work Packages (WP). ENPADASI will tackle several of the described technological challenges. Work package 2 for example will facilitate and stimulate data sharing by defining standards and minimal requirements. Work package 5 will diminish existing obstacles to data sharing by resolving and mapping ethical, IP and personal data collection issues. Work package 4 will develop relevant ontologies and mappings to facilitate data integration and scripts for actual data integration to show the added value of data sharing. Work package 3 will develop the integrated infrastructure and work package 6 will take care of the training of researchers in the use of the provided infrastructure whereas WP1, will develop plans for long-term sustainability. Within the ENPADASI project, TUM will particularly be involved in WP2 (sharing existing data). We will provide raw data sets from human studies (HUMET, Mipromet) conducted at TUM with well characterized and phenotyped healthy and prediabetic volunteers. It needs to be emphasized that both, the volunteers as well as the metabolomics measurements in these studies are extremely well standardized and therefore provide a reference for connecting other studies incorporated into ENPADASI. In HUMET, all volunteers spent 4 days in our human study unit and underwent 6 extremely well defined challenges (36h of fasting, OGTT, lipid loading tests etc.) with analysis of blood, urine and breath by various metabolomics platforms. In Mipromet, healthy and well preselected prediabetics received in cross-over design 4 different liquid test meals with comprehensive post-prandial metabolomics coverage. |
| Ergebnis (dt.): | Das Vorhaben ENPADASI hat eine open access Forschungsinfrastruktur entwickelt, in der Daten aus ernährungsrelevanten Beobachtungs- und Interventionsstudien sowie Studien mit mechanistischen Forschungsansätzen zusammengeführt werden. Ziel war dabei, die Daten-sammlung und Datenspeicherung zu standardisieren sowie den Datenaustausch zu fördern. Die Standardisierung ist dabei entscheidend, um die Verknüpfung individueller Studien zu ermöglichen, um somit zum Beispiel die statistische Power zu erhöhen und die Studienergeb-nisse und -aussagen zu stärken. Die Standardisierung umfasst sowohl die Metadaten der einzelnen Studien als auch vor allem die Erfassung phänotypischer Daten, wie beispielsweise die Befunde der klinischen Chemie, Lebensstil-Determinanten, Lebensmittelverzehr, sportli-che Aktivität sowie dichte Datensätze aus Metabolom- oder Transkriptomanalysen. Das Projekt ENPADASI erfasste insgesamt 79 Studien und machte 12 der Studien öf-fentlich zugänglich (open access). Das entwickelte System „DASH-IN" als Baustein im Vor-haben bietet nun die Möglichkeiten zur Datenintegration und der studienübergreifenden Da-tenanalyse. Damit lassen sich die Fallzahlen über die Studien erhöhen und die Breite der Ana-lysen verbessern. Es können aber auch neue Hypothesen getestet und neue Modelle entwi-ckelt werden. Zusätzlich wurden, basierend auf den gesammelten Studien und den vorgege-benen Studienmasken, neue ernährungsrelevante Stichwörter (für die Katalogisierung und Suche) erstellt und mit existierenden Ontologien verglichen. Außerdem wurde von den EN-PADASI Partnern definiert, welche Informationen in der Datenbank gespeichert werden sol-len, unter welchen Umständen Daten für einen Datenaustausch geeignet sind oder welche Schritte unternommen werden müssen, um einen Datenaustausch zu ermöglichen (z. B. durch neue Einwilligungserklärungen, Zusatzanträge, Konsortialverträge). Mit der Etablierung und dem Betrieb dieses Systems wird der Wissenschaftsgemeinschaft das im Bereich der Ernährung international fortschrittlichste Werkzeug zur Vereinigung von Datensätzen für die harmonisierte Analyse vielfältiger Datensätze zur Verfügung gestellt. |
| Ergebnis (engl.): | The project ENPADASI has developed an open access research infrastructure (RI) for studies in the area of food, diet and health related to mechanistic, interventional and epidemiological approaches. The aim within ENPADASI was to encourage and to improve standardization of data collection, data storage and exchange of data. Standardization is essential to be able to connect individual studies and thereby en-large/increase the power of the statistics and overall outcome from these studies. The standardization includes metadata with special emphasis on phenotypic data (e.g. clinical data, dietary intake, lifestyle factors, physical activity, metabolomics, and transcriptomics). The project ENPADASI has collected 79 studies and has made 12 studies open ac-cess. The established system DASH-IN includes options to perform integrated analy-sis on multiple studies to enable further exploitation of research data (hypothesis testing, scenario analysis and modelling). In addition, based on the templates and uploaded studies nutritional terms were identified that were mapped to existing on-tologies and new ontologies were developed for nutrition relevant data. Moreover, partners in the ENPADASI consortium identified which items should be stored in the database, under which conditions data can be shared with other researchers and whether some special actions are required such as a new informed consent, an amendment or a consortium agreement to be legally share the data. With the maintenance of the system, the most advanced system with nutritional and diet-relevant phenotypic data in Europe/worldwide is available as a platform to share respective scientific data. |
| Laufzeit: | Beginn: 12.12.2014 / Ende: 30.06.2017 |
| Ausf. Einrichtung: | Technische Universität München - Wissenschaftszentrum Weihenstephan - Forschungsdepartment Ernährungs- und Lebensmittelwissenschaften - Lehrstuhl für Ernährungsphysiologie, Freising |
| Themenfelder: | Wissenstransfer / Vernetzung, knowledge transfer, networking |
| Förderprogramme: | EU-Forschung |
| Schlagworte: | Ernährungskompetenz, nutrition competence, Humanernährung, human nutrition, Gesundheitlicher Verbraucherschutz, health-related consumer protection, Ernährung, nutrition, Ernährungsgewohnheiten, food pattern, Ernährungsphysiologie, nutrition physiology, Datensammlung, data collection, Fehlernährung,malnutrition, Datensammlung, data collection, Epidemiologie, epidemiology |
| Stichpunkte: | JPI HDHL (ENPADASI Knowledge Hub) |
| Förderkennzeichen: | 2814ERA07F |
| Dokument zum Download: | 2814ERA07F_Abschlussbericht ENPADASI (Teilprojekt 7).pdf (736,1 KB) 2814ERA07F_Kurzfassungen (de/en) ENPADASI (Teilprojekt 7).pdf (119,3 KB) |
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