Bundesanstalt für Landwirtschaft und Ernährung

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Titel: Verbundprojekt: Sequenzierung und Analyse des Weizengenoms - ein Beitrag Deutschlands zur International Wheat Initiative - Teilprojekt 1
Titel (englisch): Collaborative project: Sequencing and Analysis of the Wheat Genome - Contribution of Germany to the International Wheat Initiative - subproject 1
Beschreibung (dt.): In dem vorgelegten Projektvorschlag wird ein wichtiger und kritischer Beitrag zur Entschlüsselung des riesigen und äußerst komplexen Weizengenoms im Rahmen und in Koordination mit einer internationalen Initiative vorgelegt. Weizen ist agrarökonomisch sowohl weltweit als auch für Deutschland von herausragender Bedeutung. Ein Großteil der dreifachen Ertragssteigerung seit den 1950er Jahren ist auf Züchtung zurückzuführen. Um weitere quantitative und qualitative Verbesserungen sicherzustellen sind Hochdurchsatzmethoden die sich auf genomische Daten stützen eine essentielle Grundlage. Aufgrund der Grösse und Komplexität des Weizengenoms konnte diese Grundlage bisher noch nicht erarbeitet werden. Internationale Initiativen als auch technische Durchbrüche erlauben es aber nun, dieses Ziel in wenigen Jahren zu erreichen. Im Projekt sollen (I) zwei Chromosomen (2D und 6A), als Beitrag zum internationalen Weizengenomsequenzierungsprojekt in Deutschland sequenziert werden und (II) für alle 21 Weizenchromosomen die bioinformatische Analyse und Auswertung aller genomischer Daten durchgeführt und dargestellt werden. Sequenzierung und bioinformatische Analyse sind kritische Komponenten in der Entschlüsselung von Genomen. Die Antragssteller haben in der Triticeae-Genom und Weizengenomforschung national und international eine herausragende Rolle und Renommee. Sie sind in das nationale und internationale Netzwerk führend eingebettet und verfügen über umfangreiche translationale Vernetzung mit Forschungszentren, Universitäten und Industrie
Beschreibung (engl.): In the proposed project we aim to give a critical and substantial contribution for the sequencing and analysis of the huge and extremely complex bread wheat genome in collaboration and coordination with the international wheat initiative and in particular with the International Wheat Genome Sequencing Initiative (IWGSC). Both worldwide as well within Germany, wheat is of upmost agro-economic importance. Since the 1950s, the major fraction of wheat yield increase is attributable to breeding efforts and achievements. For further qualitative and quantitative improvement and increase, genomics based high-throughput methods will provide an essential foundation. Due to size and complexity of the wheat genome this foundation has been notoriously difficult to develop. However, international initiatives as well as latest technological developments and breakthroughs enable us now to achieve this goal in the foreseeable future. In the project we propose to (I) sequence two wheat chromosomes (chromosomes 6A and 2D respectively) as a contribution to the international wheat genome sequencing efforts, (II) to carry out the bioinformatic analysis of all 21 wheat chromosomes from the international efforts as well as (III) to provide the integration and communication of genome and analytical wheat genome data in a comprehensive and web accessible dedicated database. Both sequencing and bioinformatic analysis as well as downstream adequate communication to the broader community are critical components for the deciphering of the wheat genome.
Laufzeit: Beginn: 02.10.2015 / Ende: 31.03.2019
Ausf. Einrichtung: Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) - Abt. für Genomik und Systembiologie Pflanzlicher Genome, Oberschleißheim
Themenfelder: Pflanzenzüchtung, plant breeding
Förderprogramme: Programm zur Innovationsförderung des Bundesministeriums für Ernährung und Landwirtschaft
Schlagworte: Nachhaltigkeit, sustainability, Ressourcenschutz, Ressourceneffizienz, resource protection, resource efficiency, Ackerbau, crop production, Ernährungssicherung, food security, Genetische Ressourcen, genetic resources, Weizen, wheat, Pflanzengenetische Ressourcen, plant genetic resources, Kulturverfahren, cultivation
Stichpunkte: Getreide
Förderkennzeichen: 2819103915
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