Suchergebnis in den Forschungsaktivitäten der Entscheidungshilfevorhaben
| Titel: | Erstellung eines Fischkatalogs (auf Datenbankebene) mit allen analytisch verfügbaren Daten zur molekularbiologischen Fischdifferenzierung |
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| Beschreibung (dt.): | Laut Verordnung (EG) 104/2000 des Rates vom 17.12.1999 müssen Fischerzeugnisse hinsichtlich der Handelsbezeichnung, der Produktionsmethode und des Fanggebietes zweifelsfrei gekennzeichnet werden. Damit trägt die Europäische Union den in der Fischerei in den letzten Jahren eingetretenen Veränderungen (z.B. Ausweitung des Angebots) und dem Bedürfnis nach einer Verbesserung des Verbraucherschutzes Rechnung. Im Rahmen des Vorhabens soll deshalb ein Katalog zur Überprüfung der Etikettierung von Fischprodukten auf Datenbankebene erstellt werden. Der Fischkatalog soll alle analytischen verfügbaren Daten zur molekularbiologischen Fischdifferenzierung enthalten. Diese sollen für IEF (isoelektrische Fokussierung), SSCP (DANN single strand conformational polymorphism), PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction – Restriction Fragment Length Polymorphism) und DNA-Sequenz (Sequenz eines für die Artbestimmung definierten DNA-Bereichs) in Form einer Datenbank verfügbar gemacht werden. Bei der analytischen Bearbeitung wird der Schwerpunkt auf gängige Arten mit hoher wirtschaftlicher Relevanz gelegt. |
| Ergebnis (dt.): | Laut Verordnung (EG) 104/2000 des Rates vom 17.12.1999 müssen Fischereierzeugnisse hinsichtlich Handelsbezeichnung der Fisch-, Krebs- oder Weichtierart, Produktionsmethode (Meeres-, Binnenfischerei oder Aquakultur) und Fanggebiet (z.B. Nordostatlantik, Ostsee) zweifelsfrei gekennzeichnet werden. Im Rahmen des Projektes „Erstellung eines Fischkatalogs (auf Datenbankebene) mit allen analytisch verfügbaren Daten zur molekularbiologischen Fischdifferenzierung“ wurde von Mitarbeitern der Hochschule Bremen, Lisa Billecke und Kristina Dobat (AG Fischökologie Prof. Dr. Heiko Brunken), im Auftrag des Bundesamtes für Lebensmittel und Ernährung (BLE) ein Katalog auf Datenbankebene zur Überprüfung der Etikettierung von Fischprodukten erstellt. Die Aufarbeitung von DNA-Sequenzen mariner Organismen wurde von der Impetus GmbH & Co. Bioscience KG durchgeführt. Die Fa. Planomedia erstellte die datenbankbasierte Software zur Verwaltung von biologischen Fischdaten. Die Datenbank enthält analytische Daten von zurzeit handelsüblichen Fischen, Mollusken und Crustaceen zu: IEF – isoelektrische Fokussierung SSCP – DNA single strand conformational polymorphism PCR-RFLP – Polymerase Chain Reaction – Restriction Fragment Length Polymorphism DNA-Sequenz – Sequenz eines für die Artbestimmung definierten Bereichs Alignment (Vergleich mehrere DNA-Sequenzen) Die Datenbank ist im Internet frei zugänglich. Über eine Suchmaske kann der Nutzer nach den verschieden molekularbiologischen Datensätzen einer bestimmten Art suchen. Zu den meisten Arten ist ein kurzer beschreibender Text vorhanden, der Informationen zu Verbreitung und Lebensraumansprüchen liefert. Die in der Datenbank enthaltenen Daten können als Vergleichsdaten oder auch Standards zur eindeutigen Identifikation und Fischartendifferenzierung hinsichtlich der Handelsbezeichnung genutzt werden. Insgesamt befinden sich 198 Fischarten, 19 Arten von Mollusken und 14 Arten von Crustaceen in der Datenbank. Nicht zu jeder Art ist der komplette molekularbiologische Datensatz von IEF, DNA-Sequenz, RFLP, SSCP und Alignment vorhanden. |
| Ergebnis (engl.): | Fishery products, according to the regulation (EU) 104/2000 of the European Council from the 17th of december 1999, need to be clearly labled concerning to Trade name of fish-, crustacean- and mollusc species Method of production (marine fishing, freshwater fishing and aquaculture) Catching area (e.g. Northeast-Pacific, North Sea) Regarding this, a catalogue to verify the labelling of fishery products has been generated. Gain of the project was to make data such as IEF (Isoelectric focusing) SSCP – DNA single strand conformational polymorphism PCR-RFLP – Polymerase Chain Reaction – Restriction Fragment Length Polymorphism DNA-Sequencing – sequence of a defined sector for determining species Alignment – Comparison of DNA – sequences available. Main focus was set on fish species with a high economic relevance. The conceptual formulation was to sample all relevant analytic data, to choose an appropriate database programme and to enter all available data into the database. Method The compilation of the database as well as the selection of adequate software and the programming procedure was accomplished by the company Planomedia. The database is based on different Open Source components. The data processor which is used by an operator merely needs a web browser for working with the database. The refurbishment of DNA – sequences of marine organisms such as fishes, crustaceans and molluscs was undertaken by the company Impetus GmbH & Co. Bioscience KG. Results The database is clearly structured and easy to handle. The user has the facility to search after a particular fish, mollusc or crustacean by entering the german or scientific name. Another way is to go through a list of all available species if the correct name is not known. At present, the database contains analytic data from 198 fishes, 14 crustaceans and 19 molluscs. The complete data set including IEF, SSCP, RFLP, DNA and alignment is merely only available for a few species. The requirement for future users will be to complete the lacking data sets as well as to enter new analytic data of marine organisms if possible. Available to most of the species is a short summary including distribution and habitat requirements. The molecular biological methods are described as well on therefore provided pages. Conclusion The aim, to design a database for analytic information of marine organisms with high economic relevance and to enter such information into the database has been reached in therefore mentioned period of time. For further steps, the responsibility for this product will be referred to staff members of the Bundesforschungsanstalt für Ernährung und Lebensmittel (BFEL), FB Fischqualität. All data can be used as comparison or standards for definite identification and determination of species regarding to their trade name. |
| Laufzeit: | Beginn: 01.10.2004 / Ende: 31.03.2005 |
| Ausf. Einrichtung: | Fachbereich 7- Schiffbau, Meerestechnik und Internationaler Studiengang für Technische und Angewandte Biologie Hochschule Bremen, Bremen |
| Förderprogramme: | Entscheidungshilfebedarf |
| Stichpunkte: | fischetikettierung; fischdatenbank; kleinprojekt; , Fischereiwesen |