Projekte in den Förderprogrammen des BMEL, betreut durch den Projektträger BLE (PT BLE)
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| Titel: | Identifizierung phytopathogener Mikroorganismen mit dem MALDI Biotyper Verfahren (Phytotyper) |
|---|---|
| Titel (englisch): | Identification of phytopathogenic microorganisms by MALDI Biotyper (Phytotyper) |
| Akronym: | Phytotyper |
| Beschreibung (dt.): | Das Phytotyper Projekt zielt auf die spezifische Weiterentwicklung von MALDI-TOF MS basierten Methoden zur Artbestimmung von Mikroorganismen für die phytomedizinische Praxis ab. Durch den Aufbau einer umfangreichen Datenbank mit Referenzspektren zu phytopathogenen Arten, Epiphyten und Saprophyten soll eine schnelle und zuverlässige Diagnostik für Pathogene, aber auch ein schneller Ausschluss für Isolate aus nicht pathogenen Arten ermöglicht werden. Ein großer Vorteil der dabei verwendeten Techniken liegt in der breiten Anwendbarkeit eines einzigen Protokolls zu Probenaufbereitung und Auswertung auf eine breite Gruppe an Zielorganismen bei gleichzeitig sehr hoher Auflösung für die meisten abgedeckten Gattungen. Um diesen Vorteil für eine effektive phytomedizinische Beratung bestmöglich nutzbar zu machen sollen im Projekt die Differenzierung heterogener Spezies, wie den Arten aus der Pseudomonas syringae Gruppe verbessert werden. Zudem wird geprüft, ob das Biotyper Verfahren auch auf nicht kultivierbare Bakterien wie den Phytoplasmen übertragen werden kann. Die mit diesem Projekt zu erzielenden Verbesserungen in der phytobakteriologischen Diagnostik sollen im direkten praktischen Nutzen vor den Hintergrund der aktuellen gesellschaftlichen und klimatischen Herausforderungen die Beratungsmöglichkeiten sowohl für ökologischen als auch konventionellen Pflanzenbau stärken. |
| Beschreibung (engl.): | The Phytotyper projects aims to improve existing methods for MALDI-TOF MS identification of bacteria with regard to plant health related concerns. Via the built-up of a contextual reference database with high coverage of relevant pathogens as well as of saprophytic and epiphytic species, the MALDI-Biotyping technique can be of use for pathogen identification as well as for the exclusion of isolates from non-pathogenic species during the diagnostic process. The convenience of this method lies in the applicability of one single protocol for sample preparation and extraction over a wide range of samples and species, as well as providing reasonable resolution over this range. To get the most out of this technique, the resolution level for heterogenic species, such as those from the Pseudomonas syringae group, shall be improved within the frame of this project. A further advancement towards a potential identification of non-cultivable phytoplasma species will be analysed. Methods will be develop to test for a differentiation of sample material stemming from either healthy or from phytoplasma infected plants. Both, the apple proliferation phytoplasma and pear decline will be investigated for method development. The Phytotyper project provides a direct practical use for the diagnostic section of plant protection services and thereby strengthens consulting for both, organic and conventional plant production in the context of current societal and climatic challenges. |
| Laufzeit: | Beginn: 01.04.2021 / Ende: 31.10.2024 |
| Ausf. Einrichtung: | Julius Kühn-Institut Bundesforschungsinstitut für Kulturpflanzen (JKI) - Institut für Pflanzenschutz im Obst- und Weinbau, Bernkastel-Kues |
| Themenfelder: | Pflanzenschutz, Pflanzengesundheit, crop protection, plant health |
| Förderprogramme: | Ackerbaustrategie |
| Schlagworte: | Monitoring, Pflanzenschutz, Pflanzengesundheit, crop protection, plant health, Ackerbau, crop production, Obstbau, fruit production, Kernobst, pome, Pflanzenkrankheiten (Viren, Bakt., Pilze, Phytoplasmen), plant diseases (virusus, bacteria, fungi, phytoplasma) |
| Stichpunkte: | Pflanzengesundheit |
| Förderkennzeichen: | 28A8703X19 |
| Dokument zum Download: | Kein Dokument vorhanden! |
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