Suchergebnis in den Forschungsaktivitäten der Entscheidungshilfevorhaben
| Titel: | Nachweis und Differenzierung von Pflanzenviren durch PCR: Tobamoviren |
|---|---|
| Beschreibung (dt.): | Zum Routinenachweis von Pflanzenviren haben sich serologische Verfahren etabliert. Jedoch wird diese Nachweismethodik durch Mangel an geeigneten Antiseren und Kreuzreaktionen limitiert. Als Alternative bieten sich Nukleinsäure-basierende Verfahren wie die Polymerase-Kettenreaktion und die Hybridisierung an. Die Problematik von kreuzreagierenden Antiseren treten im Genus Tobamovirus auf, wodurch eine eindeutige Differenzierung von Spezies mit serologischen Methoden behindert wird. Im Projekt soll für serologisch schwierig zu differenzierende Tobamoviren ein generelles PCR-Verfahren zum genusspezifischen Nachweis etabliert werde, welches zusätzlich eine Differenzierung der Spezies gestattet. Neben der Entwicklung und Testung eines praxistauglichen Verfahrens zur Diferenzierung von Tobamovirus Spezies auf Nukleinsäurebasis wird unser Schwerpunkt als Beitrag zum Diagnoseverbund auf der Evaluierung verschiedener Methoden zur Differenzierung von PCR-Produkten liegen. Zusätzlich sollen, da aufgrund der Entwicklung neuer Technologien zunehmend Hybridisierungsverfahren wieder an Bedeutung gewinnen, auch Sonden verschiedener Genombereiche auf Ihre Eignung für den Nachweis getestet werden. |
| Ergebnis (dt.): | Tobamoviren haben eine wirtschaftliche Bedeutung für eine Anzahl von Kulturpflanzen. Insbesondere bei gartenbaulichen Kulturen können sie beträchtliche Schäden verursachen. Im Rahmen des Projektes wurde auf der Basis PCR-gestützter Methoden (hier: RT-PCR-Verfahren, Reverse Transkriptase, Polymerase-Kettenreaktion) ein einfaches, schnelles und praxistaugliches Nachweisverfahren für Tobamoviren in Pflanzen erarbeitet. Das generelles Nachweisverfahren wurde anhand von Praxisproben für sechs serologisch eng verwandte Virusspezies der Gattung Tobamovirus [hier Untergruppe der Solanacaeen-infizierenden Tobamoviren: Tobacco mosaic virus (TMV), Tomato mosaic virus (ToMV), Tobacco mild green mottle virus (TMGMV), Odontoglossum ringspot virus (ORSV), Pepper mild mottle virus (PMMV)] erfolgreich evaluiert. Die angewandte universelle Primerkombination wies eine hohe Testsicherheit auf. Einzelne Tobamovirus-Spezies können durch weitere molekulargenetische Verfahren in einem separaten Arbeitsschritt differenziert werden. Des weiteren wurde für die Nukleinsäureextrahierung (Probenvorbereitung) ein Glasmilchverfahren optimiert, welches ohne organische Lösungsmittel auskommt. |
| Laufzeit: | Beginn: 01.10.1999 / Ende: 30.11.2002 |
| Ausf. Einrichtung: | Institut für Angewandte Botanik Universität Hamburg, Hamburg |
| Förderprogramme: | Entscheidungshilfebedarf |
| Stichpunkte: | viren; pcr; diagnose; diagnose-verbund; gartenbau; , Pflanzenschutz |
| Förderkennzeichen: | 2898HS017 |
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Weizen Stroh
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Weizen*
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"Kleegras und Grünland"
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