Forschungsprojekte des Projektträgers der BLE
| Titel: | Molekulargenetische Charakterisierung von Kirschengenotypen der DGO mittels eines SNP Marker Arrays |
|---|---|
| Beschreibung (dt.): | 296 Süßkirschen- und 66 Sauerkirschengenotypen der Deutschen Genbank Obst (DGO) sowie jeweils 50 Vergleichssorten aus dem internationalen Kirschensortiment sollen mittels des hochauflösenden Infinium RosBREED Cherry_V2 Genotyping Arrays molekulargenetisch charakterisiert werden, wozu auch die dafür notwendige Isolierung der genomischen DNA aller 462 Genotypen aus Blattproben durchzuführen ist. Auch sind mögliche Duplikate zu identifizieren. |
| Ergebnis (dt.): | In dem hochauflösenden RosBREED Cherry_V2 Genotyping Array fanden sich jeweils mehrere Tausend SNP-Marker zur Identifizierung der diploiden Süß- und der tetraploiden Sauerkirschengenotypen. Anhand dieser konnte mit Hilfe der Software NTSYS eine Verwandtschaftsanalyse durchgeführt werden. Nach Erstellung des Stammbaumes wurden Duplikate, Triplikate bis hin zu Multiplikaten identifiziert. Das Ergebnis führte zu einer Reduktion der untersuchten 352 Süßkirschengenotypen auf 303 eindeutig unterscheidbare Akzessionen. Die Zahl der pomologisch beschriebenen Sauerkirschengenotypen konnte von 108 auf 58 molekulargenetisch unterscheidbare Genotypen reduziert werden. Das Ziel der Identifizierung der Duplikate bei Sauerkirschenproben inklusive einer eindeutigen Allelzuordnung konnte nur eingeschränkt erreicht werden. Daher wird zur Charakterisierung dieser tetraploiden Pflanzen die Entwicklung eines neuen Arrays mit ausschließlich genomspezifischen Markern empfohlen. Molekulare Methoden wie z. B. Genotyping by Sequencing könnten in Betracht gezogen werden. Die Untersuchung von ausgewählten Kirschengenotypen der Deutschen Genbank Obst (DGO) konnte somit wertvolle Hinweise hinsichtlich der molekulargenetischen Differenzierung erbringen. Die Daten stehen für vertiefte Verwandtschaftsanalysen, die Identifizierung von Duplikaten und weiterführende genetische Merkmalsuntersuchungen zur Verfügung. Damit konnte ein bedeutender Teilbestand der DGO für die nachhaltige Nutzung mithilfe molekulargenetischer Methoden erschlossen werden. |
| Laufzeit: | Beginn: 15.08.2019 / Ende: 14.05.2020 |
| Ausf. Einrichtung: | TraitGenetics GmbH, Gatersleben |
| Themenfelder: | Biologische Vielfalt, biological diversity |
| Förderprogramme: | Erhebungen |
| Schlagworte: | Pflanzenbau, crop production, Ressourcenschutz, Ressourceneffizienz, resource protection, resource efficiency, Gartenbau, horticulture, Obstbau, fruit production, Genetische Ressourcen, genetic resources, Steinobst, stone fruit, Evaluation, evaluation, Pflanzengenetische Ressourcen, plant genetic resources, Saat- und Pflanzgut, seed and planting material |
| Förderkennzeichen: | 2819BE001 |
| Dokument zum Download: | 19BE001 Abschlussbericht_2020_07_09.pdf (808 KB) |
Kontakt: |
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