Bundesanstalt für Landwirtschaft und Ernährung

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Titel: Genetische Charakterisierung der gefährdeten Schafrasse Rouge de Roussillon und Erstellung eines Erhaltungszuchtprogramms
Beschreibung (dt.): Im vorliegenden Projekt 'Genetische Charakterisierung der gefährdeten Schafrasse Rouge de Roussillon und Erstellung eines Erhaltungszuchtprogramms' sind vom Antragsteller insbesondere folgende Ziele zu erreichen: Beprobung wesentlicher Bestände der Rouge de Roussillon-Schafe in Österreich, Frankreich und insbesondere in Deutschland; Europaweite genetische Einordnung der Rouge de Roussillon-Schafe anhand genetischer Substrukturen mittels Mikrosatellitenmarkern / Abgrenzung der Rouge de Roussillon-Schafe von Referenzrassen; Erstellen einer Rassebeschreibung und Abstimmung von Selektionskriterien für ein länderübergreifendes Erhaltungszuchtprogramm; Kryokonservierung von zuvor gewonnenen Stammzellen aus regenerativen Leukozyten; Errichtung eines allen Beteiligten zu gleichen Bedingungen zugänglichen Internetforums insbesondere für Züchter mit konkreten Verpaarungsvorschlägen für ihre Rouge de Roussillon-Schafe
Ergebnis (dt.): Einführung:
Es wurden 302 Tiere der gefährdeten Schafrasse Rouge du Roussillon (RdR), sowie der Referenzrasse Coburger Fuchsschaf genetisch charakterisiert. Die Rasse stammt aus Frankreich und wird seit 1981 auch in Deutschland gezüchtet. In Frankreich existieren zwei Subtypen, die seit 1993 separat gezüchtet werden und hier als alter und neuer französischer Typ bezeichnet werden.

Methode:
Die Tiere wurden mit 15 Mikrosatellitenmarkern typisiert, verschiedene phänotypische Merkmale erhoben und Pedigreedaten ausgewertet.
Die Populationsstruktur der Rasse wurde analysiert und zusätzlich 57 weitere Schafrassen einbezogen um die Rasse in einen europäischen Kontext einzuordnen. Regenerative Zellen der Tiere wurden als Kryoreserve konserviert, eine Rassebeschreibung und ein Erhaltungszuchtplan erstellt.

Ergebnisse:
Die phäno- und genotypischen Daten zeigen deutliche Unterschiede zwischen den drei Subtypen der Rasse. In der deutschen Population konnten verschiedene Parameter erhoben werden, die auf eine geringe genetische Variabilität innerhalb der Population hinweisen. Beim neuen französischen Typ wurden Hinweise für eine Einkreuzung gefunden. Im europäischen Kontext ist Rasse deutlich von den anderen europäischen Rassen abgegrenzt.

Zusammenfassung:
Es wurde eine hohe genetische Nähe der deutschen Population zum alten französischen Typ festgestellt. Beide sollten in einem gemeinsamen Zuchtprogramm erhalten werden. Aufgrund der Hinweise, dass im neuen französischen Typ Einkreuzungen stattgefunden haben, sollten die beiden französischen Typen getrennt weitergezüchtet werden, um eine Reinzucht des alten Typs zu ermöglichen. Eine offizielle Anerkennung des alten französischen Typs wird empfohlen. Bei der Einordnung in einen europäischen Kontext zeigt sich, dass es sich beim RdR um eine eigenständige Rasse handelt, die genetisch einzigartig ist.
Ergebnis (engl.): Introduction:

302 animals of the highly endangered sheep breed Rouge du Roussillon (RdR) and the reference breed Coburger Fuchsschaf were analysed with 15 microsatellite markers. The breed originates in Southern France and since 1981 there exists a breeding population of about 80 animals in Germany. In France there are 2 subtypes of the breed, which differ phenotypically and genetically and are to be called the Old French Type (about 150 animals) and the New French Type (circa 3500 animals) in this study. The German population originates from the same herd as the Old French type but the populations have been separated for 30 years now. In Germany it was bred pure blood over this period of time. The breeding program for the New French Type was implemented 17 years ago with the focus set on a high meat performance. The Old French Type should be considered as a distinct endangered breed in the FAO classification.

Methods:

Genetic variation and population structure was investigated with a set of 15 microsatellites. Genetic distances, phylogenetic trees, the number of alleles, allele frequencies, hetero¬zygosity, deviations from the Hardy-Weinberg-equilibrium, F-statistics after Nei (1972) and Weir and Cockerham (1984), and Nei´s Gst (1973) have been estimated with diverse computer programs. Phenotypic data and pedigree information was collected and analysed.
Furthermore the breed was set into context with 57 sheep breeds from Europe and the Middle East examined in another project (ECONOGENE). For this purpose a Principle Component Analysis and a Bayesian Model-based Clustering analysis were performed and individuals were assigned to populations.
From the collected data a conservation breeding program was developed and implemented, and a breed description has been developed. Regenerative cells of the animals have been cryo-conserved.

Results:

The phenotypic and genetic data showed the subdivision of the breed in 3 subtypes. The German population showed considerable signs of inbreeding in different parameters. The Old French type and the German population revealed a low genetic distance to each other.
The New French type revealed indications of crossbreeding with other breeds. In the European context the Rouge du Roussillon was clearly differentiated from the other European breeds. The analysis of the pedigree data showed an inbreeding coefficient (F) of 4,32 and an effective population size (Ne) of 37,33.




Conclusion:

There are three phenotypical and genotypically separated subtypes of the breed in Germany and France. A low genetic differentiation between the German population and the Old French type suggests that these populations should be conserved as a combined population and included in a conjoint conservation breeding program. Since crossbreeding seems to have appeared in the New French type, it should be bred separately from the Old French type to assure the pure bred breeding of the Old French type. We recommend that an FAO status of endangered sheep breed be given to the Old French Type and measures for its protection to be taken.
As a major goal of the breeding program a decrease of the inbreeding coefficient and an increase of the effective population size should be constituted.
The distinct separation of the breed from the other European breeds indicates that the Rouge du Rousillon sheep is a discreet breed with evident genetic potential, and therefore the effort for its conservation should be continued and even intensified.

Acknowledgement:

The study was financially supported by the Bundesministerium für Ernährung, Landwirtschaft und Verbraucherschutz, Germany; Tiergarten Nürnberg; Verein der Tiergartenfreunde Nürnberg; Greenpeace; the Gesellschaft zur Erhaltung alter und gefährdeter Haustierrassen e.V. and the Gesellschaft für Internationale Nutztierrassen-Vielfalt in Deutschland e.V.
Laufzeit: Beginn: 01.10.2008 / Ende: 31.03.2010
Ausf. Einrichtung: Justus-Liebig-Universität Gießen - Fachbereich 9 Agrarwissenschaften, Ökotrophologie und Umweltmanagement - Institut für Tierzucht und Haustiergenetik, Gießen
Themenfelder: Tierzucht, animal breeding
Förderprogramme: Modell- und Demonstrationsvorhaben
Schlagworte: Biologische Vielfalt, biological diversity, Wissenstransfer / Vernetzung, knowledge transfer, networking, Genetische Ressourcen, genetic resources, Agrobiodiversität, agricultural biodiversity, Kleinwiederkäuer, small ruminants, Tiergenetische Ressourcen, animal genetic resources
Förderkennzeichen: 2807BM037
Dokument zum Download: 07BM037.pdf (1,3 MB)

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