Bundesanstalt für Landwirtschaft und Ernährung

Forschungsprojekte des Projektträgers der BLE

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Titel: Molekulargenetische Sortenbestimmung der Deutschen Genbank Obst - Erdbeere
Beschreibung (dt.): Alle Erdbeersorten der Deutschen Genbank Obst (DGO), die bereits pomologisch bestimmt worden sind bzw. noch zu bestimmen sind, werden anhand von definierten Mikrosatelliten einer molekulargenetischen Überprüfung unterzogen. Die Überprüfung erfolgt in Anlehnung an die Ergebnisse des Europäischen Forschungsprojektes GenBerry (GENRES 036) mit einem Set von 20 SSR Markern. Die Ergebnisse sind auszuwerten und anhand von 6 definierten Referenzgenotypen zu validieren. Sofern sich die pomologische und molekulargenetische Bewertung der Pflanzen in Einzelfällen unterscheidet, ist die molekulargenetische Überprüfung der betreffenden Blattproben auf Geheiß der Koordinationsstelle der DGO zu wiederholen. Sämtliche Ergebnisse sollen der Datenbank der DGO zugearbeitet werden.
Ergebnis (dt.): Blattproben von 951 Erdbeerpflanzen aus zwei Sammlungen der Deutschen Genbank Obst, die nach einer pomologischen Bestimmung 220 Sorten umfassten, wurden in Anlehnung an die Ergebnisse des Europäischen Forschungsprojektes GenBerry (GENRES 036) mit einem Set von 19 definierten SSR-Markern molekulargenetisch charakterisiert. Zur Definition von abgrenzbaren Gengruppen wurde basierend auf der Verteilung der paarweisen Distanzen des gesamten Datensatzes der Distanz Cut-Off bei 0,1 festgelegt. Damit fallen alle Proben, welche mehr als 90 % identische Allele besitzen, in eine Gengruppe. Anhand der anschließend durchgeführten Analyse konnte aufgedeckt werden, dass ein Teil der beprobten Pflanzen mit einem falschen Namen versehen war. Pflanzen von 69 Sorten konnten in 30 Gengruppen eingruppiert, einige unter einem Sortenname geführte Pflanzen aber auch verschiedenen Gengruppen zugeteilt werden. Insgesamt sind 192 Sortenprofile gebildet worden, die nun eine gute Grundlage für zukünftige Sortenechtheitsüberprüfungen darstellen. Die Rohdaten sind im Bestand der Koordinierungsstelle der Deutschen Genbank Obst am Julius-Kühn-Institut, Institut für Züchtungsforschung an Obst in Dresden-Pillnitz.
Laufzeit: Beginn: 02.05.2016 / Ende: 01.05.2018
Ausf. Einrichtung: Ecogenics GmbH, Schlieren
Themenfelder: Biologische Vielfalt, biological diversity
Förderprogramme: Erhebungen
Schlagworte: Pflanzenbau, crop production, Ressourcenschutz, Ressourceneffizienz, resource protection, resource efficiency, Obstbau, fruit production, Genetische Ressourcen, genetic resources, Gartenbau, horticulture, Beerenobst, berry fruit, Pflanzengenetische Ressourcen, plant genetic resources, Evaluation, evaluation, Saat- und Pflanzgut, seed and planting material
Förderkennzeichen: 2809BE009
Dokument zum Download: 09BE009 Abschlussbericht_2018_06_19.pdf (2 MB)

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