Bundesanstalt für Landwirtschaft und Ernährung

Projekte in den Förderprogrammen des BMEL, betreut durch den Projektträger BLE (PT BLE)

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Titel: Zweite molekulargenetische Bestimmung der Kirschsorten der DGO
Beschreibung (dt.): 617 Süßkirsch- und 170 Sauerkirschbäume, welche in der Deutschen Genbank Obst (DGO) an sieben Standorten erhalten werden und bereits pomologisch bestimmt worden sind bzw. noch zu bestimmen sind, sollen molekulargenetisch auf ihre Sortenzugehörigkeit überprüft werden. Die Überprüfung hat entsprechend der Richtlinien des 'Fruit Network of the European Cooperative Programme for Plant Genetic Resources (ECPGR)' mit den darin definierten Mikrosatelliten-Markersystemen und Referenzsorten zu erfolgen. Die Ergebnisse sollen ausgewertet und der Datenbank der DGO in schriftlicher und elektronischer Form zugearbeitet werden. Sofern sich die pomologische und molekulargenetische Bewertung der Pflanzen in Einzelfällen unterscheidet, ist die molekulargenetische Überprüfung der betreffenden Pflanzen auf Geheiß der Koordinationsstelle der DGO zu wiederholen.
Ergebnis (dt.): Blattproben von 787 Kirschbäumen aus sieben Sammlungen der Deutschen Genbank Obst (DGO) wurden nach einer europäischen Standardmethode für Kirschen mit 16 Mikrosatellitenmarkern molekulargenetisch charakterisiert (Clarke and Tobutt 2009 ). Diese Methode war auch schon bei der ersten DNA-Analyse von 1.398 Kirschbäumen der DGO angewandt worden (FKZ: 2809BE008). Bei der statistischen Auswertung wurden 367 molekulargenetische Profile der ersten Überprüfung mit herangezogen. Basierend auf der Verteilung der paarweisen Distanzen des gesamten Datensatzes wurde zur Bildung einer abgrenzbaren Gengruppe der Distanz Cut-Off bei 0,2 festgelegt. Damit fallen alle Proben, welche mehr als 80 % identische Allele besitzen, in eine Gengruppe. 67 Sauerkirschengengruppen und 409 Süßkirschengengruppen konnten statistisch ermittelt werden. Die 476 molekulargenetischen Profile stellen nun eine gute Grundlage für zukünftige Sortenechtheitsüberprüfungen dar. Die Rohdaten sind im Bestand der Koordinierungsstelle der Deutschen Genbank Obst am Julius-Kühn-Institut, Institut für Züchtungsforschung an Obst in Dresden-Pillnitz hinterlegt.
Laufzeit: Beginn: 14.02.2017 / Ende: 13.02.2019
Ausf. Einrichtung: Ecogenics GmbH, Schlieren
Themenfelder: Biologische Vielfalt, biological diversity
Förderprogramme: Erhebungen
Schlagworte: Pflanzenbau, crop production, Ressourcenschutz, Ressourceneffizienz, resource protection, resource efficiency, Gartenbau, horticulture, Obstbau, fruit production, Genetische Ressourcen, genetic resources, Steinobst, stone fruit, Evaluation, evaluation, Pflanzengenetische Ressourcen, plant genetic resources, Saat- und Pflanzgut, seed and planting material
Förderkennzeichen: 2816BE004
Dokument zum Download: 16BE004 AB_Kirsche_Final_2018_11_22.pdf (1,4 MB)

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