Forschungsprojekte des Projektträgers der BLE
| Titel: | Erste molekulargenetische Bestimmung der Pflaumensorten der Deutschen Genbank Obst |
|---|---|
| Beschreibung (dt.): | Vertragsggegestand ist die erste molekulargenetische Charakterisierung und Prüfung der Sortenzugehörigkeit von 1.430 Pflaumenbäumen der Deutschen Genbank Obst (DGO), die an neun Standorten von sammlungshaltenden Partnern vorgehalten werden. Hierzu sind vor Ort Blattproben zu entnehmen, diese unmittelbar in flüssigen Stickstoff (oder zumindest auf Trockeneis) zu überführen und anschließend bis zur weiteren Bearbeitung bei -80°C einzulagern. Die Charakterisierung hat entsprechend der Richtlinien des 'Fruit Network of the European Cooperative Prpgramme for Plant Genetic Resources' (ECPGR) mit neun definierten SSR-Markern zu erfolgen und die Ergebnisse sind anhand von sieben ECPGR-Referenzgenotypen zu validieren. Die Ergebnisse sollen ausgewertet und der Datenbank der DGO in schriftlicher und elektronischer Form zugearbeitet werden. Sofern sich die pomologische und molekulargenetische Bewertung der Pflanzen in Einzelfällen unterscheidet, ist die molekulargenetische Überprüfung der betreffenden Pflanzen auf Geheiß der Koordinationsstelle der DGO zu wiederholen. |
| Ergebnis (dt.): | Insgesamt wurden 1507 Blattproben, welche einen großen Anteil an der biologischen Vielfalt der Pflaumensorten in Deutschland repräsentieren, molekulargenetisch analysiert. Aus den Proben wurde die DNA mittels Machery Nagel NucleoSpin Plant Kit II isoliert. Von jeder Probe wurden neun bekannte Mikrosatelliten Loci mit zwei Multiplex PCR amplifiziert und mittels Kapillarelektrophorese analysiert. Die so erzeugten Chromatogramme wurden ausgewertet und für jede Probe wurde ein entsprechendes molekulargenetisches Profil erstellt. Alle molekulargenetischen Profile wurden mittels paarweiser Distanzen und Clusteranalyse einer Gengruppe zugeordnet. Im Rahmen der Genotypisierung konnten 351 Gengruppen mit einem Cut-off-Wert von 0.2-Distanzen ermittelt werden. 346 Gengruppen wurden in der ersten Analyserunde definiert und beim Abgleich der 83 Proben aus der zweiten Analyserunde mit den Gengruppen aus der ersten Analyserunde konnten 78 Proben einer bestehenden Gengruppe zugeordnet werden. Fünf Proben konnten keiner dieser Gengruppe zugeordnet werden. Diese Probenprofile haben eine neue Gengruppennummer (361-365) erhalten. Es kann aufgrund der Hexaploidie von Pflaumen keine feinere Unterteilung, zum Beispiel in Genuntergruppen, vorgenommen werden. Die im Kontext dieser Studie gewonnenen Daten stellen eine geeignete Referenzdatenbank dar, um zukünftig Echtheitsüberprüfungen bei Pflaumenakzessionen durchführen zu können. |
| Laufzeit: | Beginn: 16.02.2021 / Ende: 15.02.2023 |
| Ausf. Einrichtung: | Microsynth ecogenics GmbH, Balgach |
| Themenfelder: | Biologische Vielfalt, biological diversity |
| Förderprogramme: | Erhebungen |
| Schlagworte: | Pflanzenbau, crop production, Ressourcenschutz, Ressourceneffizienz, resource protection, resource efficiency, Gartenbau, horticulture, Obstbau, fruit production, Genetische Ressourcen, genetic resources, Steinobst, stone fruit, Evaluation, evaluation, Pflanzengenetische Ressourcen, plant genetic resources, Saat- und Pflanzgut, seed and planting material |
| Förderkennzeichen: | 2820BE002 |
| Dokument zum Download: | 20BE002 Abschlussbericht.pdf (1 MB) |
Kontakt: |
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