Forschungsprojekte des Projektträgers der BLE
| Titel: | 'Erste molekulargenetische Bestimmung der Birnensorten der Deutschen Genbank Obst' |
|---|---|
| Beschreibung (dt.): | Bei Birnen sind 1.933 verschiedene Einzelproben (Bäume) mit den 17 vom ECPGR empfohlenen SSR-Markern CH01d08, CH01d09, CH01f07a, CH02b10, CH03d12, CH03g07, CH04e03, CH05c06, EMPc11, EMPc117, GD147, GD96, CH_Vf1, CH04c07, CH05a02, GD142, NZ05g8 beschrieben in Evans et al. (2009) [Harmonising fingerprinting protocols to allow comparisons between germplasm collections - Pyrus. Acta Hortic 814:103–106] zu untersuchen. Hierzu sind an den Standorten der acht sammlungshaltenden Partnern Blattproben zu entnehmen, diese tiefgefroren zu lagern, aufzubereiten und anhand von Referenzproben zu analysieren. Danach sind alle Proben nach (nahezu) identischen Fingerprints zu sortieren und jedem einzelnen Fingerprint eine eindeutige Identifikationsnummer (ID) zu vergeben und diese in einer Tabelle aufzulisten. Optional sind bis zu 100 weitere Proben auf Geheiß der Koordinationsstelle der Deutschen Genbank Obst zu entnehmen und zu analysieren. |
| Ergebnis (dt.): | Von 1.914 Birnbäumen in den Sammlungen der Deutschen Genbank Obst sowie von 16 Referenzbäumen konnte ein molekulargenetisches Profil erstellt werden. Der Referenzgenotyp Pyrus pyrifolia cv. `Hosui‘ zeigte ein Profil, welches nicht dem in der Fachliteratur veröffentlichten entsprach. Daher konnte dieses nicht zur Validierung herangezogen werden. Alle molekulargenetischen Profile wurden mittels paarweiser Distanzen und Clusteranalyse einer Gengruppe zugeordnet. Der Cut-Off-Wert betrug 0,2. Es wurden 425 Gengruppen mit einem jeweils repräsentativen Proben-Profil definiert, welche als Referenzen für zukünftige Sortenprüfungen verwendet werden können. Im Rahmen der 47 Wiederholungsbeprobungen konnten einige Korrekturen der ersten Beprobung in den Sammlungen Müncheberg und Triesdorf erzielt werden. Die im Kontext dieser Studie gewonnenen Daten stellen eine geeignete Referenzdatenbank dar, um zukünftig Echtheitsüberprüfungen bei Birnenakzessionen durchführen zu können. |
| Laufzeit: | Beginn: 16.02.2021 / Ende: 15.02.2023 |
| Ausf. Einrichtung: | Microsynth ecogenics GmbH, Balgach |
| Themenfelder: | Biologische Vielfalt, biological diversity |
| Förderprogramme: | Erhebungen |
| Schlagworte: | Pflanzenbau, crop production, Ressourcenschutz, Ressourceneffizienz, resource protection, resource efficiency, Gartenbau, horticulture, Obstbau, fruit production, Genetische Ressourcen, genetic resources, Kernobst, pome, Evaluation, evaluation, Pflanzengenetische Ressourcen, plant genetic resources, Saat- und Pflanzgut, seed and planting material |
| Förderkennzeichen: | 2820BE003 |
| Dokument zum Download: | 2820BE003 Abschlussbericht.pdf (1,1 MB) |
Kontakt: |
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