Bundesanstalt für Landwirtschaft und Ernährung

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Titel: Genom-basierte Ansätze zur Verbesserung der Aquakultur zweier mariner Stör-Arten: Atlantischer Stör (Acipenser oxyrinchus) und Hausen (Huso huso) - Teilvorhaben 1
Titel (englisch): Genome-based approaches for improvement of aquaculture in two marine sturgeon species: Atlantischer Stör (Acipenser oxyrinchus) and Beluga (Huso huso)
Akronym: STURGEoNOMICS
Beschreibung (dt.): In vier Teilprojekten (WP1-4) werden genombasierte Ansätze zur Verbesserung der Aquakultur zweier mariner Störarten verfolgt: Atlantischer Stör (Acipenser oxyrinchus) und Hausen (Huso huso). WP1 und WP2 werden größtenteils andernorts durchgeführt; WP3 & 4 haben den Schwerpunkt am IGB. WP3 (Deutschland/Rumänien) umfasst Populationsgenomik zur Verbesserung von Aquakultur- und Wiedereinführungszucht; einerseits Erforschung der genomischen Substruktur der Hausen-Bestände der Donau (Rumänien), andererseits der nativen Atlantischen Stör-Bestände und Vergleich mit der Erhaltungszucht in Deutschland. Ziele sind Vermeidung von Inzucht, Verbesserung der Genom-Ausstattung und des Erhaltungszucht-Managements sowie nachhaltige Fischerei. Im WP4 (Deutschland/Rumänien) werden Genom-Information (positiv selektierte Gene) und Transkriptome (RNAseq) bei Nachwuchs aus Gefangenschaftszucht genutzt, um Kandidaten-Gene für Zucht auf Ziel-Eigenschaften experimentell zu ermitteln, um sie künftig in der kommerziellen und Erhaltungsaquakultur anzuwenden. WP3 umfasst Populationsgenomik und erstreckt sich über drei Jahre. DNA-Proben von H. huso repräsentieren Laichgemeinschaften, die sich an Donau-Abschnitte und Wanderungszeiten angepasst haben. Bei A. oxyrhinchus stammen sie von der Ostkanadischen Küste und aus der Erhaltungszucht in Mecklenburg. ddRAD-seq erfolgt nach Parchman et al. (2012), die Analyse mit der STACKS-Pipeline (Catchen et al. 2013), sowie Alignierung mit den Genomen beider Arten (WP1). Ein SNP-Katalog zur Charakterisierung der A. oxyrhinchus-Stamm-Populationen in Kanada, deren Repräsentanz in der Erhaltungszucht in Mecklenburg und der Subpopulationen von H. huso in der Donau sowie Aquakultur wird erstellt und publiziert. WP4 erstreckt sich ebenso über drei Jahre, wobei mittels Aquakultur-Experimenten an beiden Stör-Arten Kandidaten-Gene charakterisiert werden, die Immunität und Krankheitsresistenz, Wachstum sowie Geschlechtsbestimmung und -entwicklung beeinflussen.
Laufzeit: Beginn: 01.09.2017 / Ende: 31.12.2020
Ausf. Einrichtung: Forschungsverbund Berlin e.V. - Leibniz-Institut für Gewässerökologie und Binnenfischerei, Berlin
Themenfelder: Tierzucht, animal breeding
Förderprogramme: EU-Forschung
Schlagworte: Tierzucht, animal breeding, Tierzucht, animal breeding, Aquakultur, aquaculture, Aquakultur, aquaculture, Aquakultur, aquaculture, Fische, fish
Stichpunkte: COFASP (3. Call)
Förderkennzeichen: 2816ERA04G
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